本所課程乃針對本所不同組別之發展重點與方向，旨在提供學生必要的音樂觀念架構，以期達到具獨立研究能力之目標，故課程與規劃上，除了滿足所的方向，同時也兼顧不同組的發展重點。本所課程分：

1. 研究所的課程：先修（補修）、必修與選修
   1. 先修課程乃大學的基礎課程，學生應在大學部即已修畢，若在大學部未曾修過，或在入學考試中未達標準者，皆需補修，但不算畢業學分。
   2. 研究所必修課程乃奠定所有學生具研究能力之基本課程。
   3. 研究所選修課程提供給各組的必修與選修課程
2. 各組的課程：先修（補修）、必修與選修
   1. 先修：乃各組之大學基礎課程，若在大學部未曾修過，或在入學考試中，未能達標準者，皆需補修，但不算學分。
   2. 必修：每一組的專業應修課程。
   3. 選修：每一組提供給學生依研究方向與興趣而選擇之程。